Hipotez bilimsel sürecin başlangıç noktasıdır. 'Eğer... ise... olur' formatında kurulur ve gözlemlenebilir, ölçülebilir, çürütülebilir olmalıdır. Bir hipotez defalarca test edilip doğrulandıkça teori haline gelir; ama hiçbir bilimsel teori kesin doğru değil, yeni kanıtlarla çürütülebilir.
Halk dilinde 'hipotez' ile 'teori' sıklıkla karıştırılıyor. Bilimde teori hipotezden çok daha güçlü; kapsamlı verilerle desteklenmiş açıklama demek. 'Evrim teorisi sadece bir hipotez' demek bilimsel terminolojiyi yanlış kullanmak.
Darwin'in doğal seçilim hipotezi başlangıçta pek çok bilim insanı tarafından reddedildi. Yüz elli yılı aşkın süredir binlerce araştırmayla test edildi, desteklendi ve geliştirildi. Artık evrim bir hipotez değil, çok güçlü kanıtlarla desteklenen bir teori.